2015年，西南聯大舊址列為國家級海峽兩岸交流基地，是雲南省當年唯一一家入選單位，也是迄今為止全國高校中唯一的入選單位。近年來，西南聯大舊址依託自身的歷史文化優勢，不斷在加強對臺交流工作，做好對臺參觀交流服務工作，積極發揮博物館在海峽交流中的重要作用。
