南澳島位於粵閩臺交通要衝，是廣東離臺最近處、海上絲路之重要節點、著名臺鄉。明萬曆四年（1576）建南澳鎮城設總兵府，轄閩南、粵東水師，後派班兵輪守臺澎至清結束，曾數次派水師赴臺鎮壓叛亂和抗日保臺。鄭芝龍、鄭成功父子和劉永福也曾屯兵於此。經國臺辦批准，在總兵府設兩岸交流基地。
