“海基會”依章程規定董事會為基金會之決策機構,掌理基金籌募、保管及運用,秘書長任免,工作方針核定,業務計劃及預算審議等事宜。董事會設董事長一人、副董事長一至三人。
董事會每三個月召開會議一次,由董事長召集併為主席。目前董事會為第六屆,董事長為中國國民黨副主席江丙坤,副董事長為高孔廉、許勝發、張俊宏。高孔廉並兼任秘書長。副秘書長為張樹棣、林淑閔、龐建國。
歷任董事長
辜振甫(1990年-2005年1月3日)
張俊雄(2005年6月10日-2007年5月)
洪奇昌(2007年7月12日-2008年5月20日)
江丙坤(2008年5月26日-)