根據該紀要，雙方同意：凡持有效旅行證件往返兩岸的旅客均可搭乘客運包機；儘快協商開通兩岸直達航路和建立雙方空管方面的直接交接程式；在直達航路開通前，包機航路得暫時繞經香港飛行(航)情報區；簡化客、貨通關手續，為旅客及機組人員提供便利；對承運人租用機場公共保稅倉庫儲備飛機維修配件，提供便利並予以保稅監管；包機承運人得在對方航點設立辦事機構；儘快就開通兩岸定期直達航班進行協商；在週末客運包機實施後3個月內就兩岸貨運包機進行協商，並儘速達成共識付諸實施。

　　大陸方面同意先行開放北京、上海(浦東)、廣州、廈門、南京五個週末包機航點，並陸續開放成都、重慶、杭州、大連、桂林、深圳，以及其他有市場需求的航點。臺灣方面同意開放桃園、高雄小港、臺中清泉崗、臺北松山、澎湖馬公、花蓮、金門、臺東等八個週末包機航點。