日前，交通運輸部發佈《關於臺灣海峽兩岸間海上直航實施事項的公告》（簡稱《公告》），對經營兩岸間航運業務的航運公司和營運船舶實施行政許可。在大陸註冊的航運公司，其他航運公司委託其在大陸的船舶代理人，向交通運輸部報送齊全、有效的申請文件後20日內，交通運輸部將決定許可或不許可其從事兩岸間海上直接運輸業務。
海峽兩岸關係協會與海峽交流基金會11月4日簽署的《海峽兩岸海運協議》即將於本月中旬生效，兩岸同胞渴望了30年之久的兩岸海上直接通航變為現實。依據《海峽兩岸海運協議》和相關法律、法規、規章而制定的《公告》，自12月15日起施行。
根據《公告》，在兩岸註冊的兩岸資本且具有企業法人資格的航運公司，經許可後，可從事兩岸間海上直接運輸業務。從事兩岸間海上直接運輸業務，須使用兩岸資本並在兩岸登記的船舶。獲許可的航運公司及其船舶名單將在交通運輸部網站公佈。
據悉，目前，兩岸共有18家公司的30多艘船舶從事兩岸三地集裝箱班輪運輸。此外，不定期的兩岸三地散雜貨運輸，貨種有1200多種，包括煤炭、砂石等。《公告》實施後，航運企業可以結合兩岸貿易、人員往來需求和航運市場狀況，提交直航申請，合理投放運力。
對於在《公告》發佈前經許可已經從事兩岸試點直航運輸、兩岸三地集裝箱班輪運輸、砂石運輸的兩岸資本的方便旗船，航運公司向交通運輸部申請特別許可並換發《臺灣海峽兩岸間水路運輸許可證》和《臺灣海峽兩岸間船舶營運證》後，可從事兩岸間海上直接運輸。在《公告》發佈前經許可已經取得兩岸間不定期船舶運輸經營資格的航運公司，符合直航條件的，向交通運輸部申請並換發相關證件後，可從事兩岸間海上直接運輸。兩岸資本並在香港特別行政區登記的船舶，經許可後，可參與兩岸間海上直接運輸；未經特別許可，外國航運公司及外國籍船舶不得從事兩岸間航運業務。
海事管理機構按照《公告》的相關要求，依照《臺灣海峽兩岸直航船舶監督管理暫行辦法》（簡稱《辦法》）對直航船舶實施監督管理。對未經許可擅自經營兩岸間航運業務的船舶，海事管理機構不得為其辦理進出港口手續，對非法經營兩岸間航運業務的船舶依法處罰。《辦法》也將於12月15日起施行。
