4月24日，海峽兩岸關係協會復函臺灣海峽交流基金會，再次感謝海基會和臺灣各界對青海玉樹地震災區的援助。
23日晚，海基會致函海協會表示：“貴方青海省玉樹藏族自治州玉樹縣地震災情嚴重，民眾生命財産遭受重大損失，我方再度表達慰問與關切。”並表示，臺灣方面將通過兩會平臺捐贈100萬美元協助災後重建。
海協會在回函中表示：“青海玉樹地震發生以來，貴會和臺灣各界及有關團體紛紛表達關切和慰問，捐款捐物支援救災，並派出醫療隊參與傷員救治，充分體現了急難互助的同胞情誼。我會再次轉請貴會表達感謝。”對於海基會捐款，海協會將轉交有關方面，用於災區重建。
