據臺灣媒體報道，臺當局高層人事布局已最後定案，舊“內閣”11日總辭。分析文章認為，觀察這波“府院”人事改組的痕跡，陳水扁顯然是有意維持黨內接班梯隊的權力平衡。
相關人士分析，陳水扁是項人事安排兼具多元意義。陳水扁提前讓蘇貞昌到中央接受歷練，接觸更多全臺性乃至國際事務。曾任“行政院”、“總統府秘書長”的邱義仁回到“國安會’”後，可以更強化“國安會”幕僚功能，也可以讓邱在年底“立委”大選繼續發揮其運籌帷幄專長，協助陳水扁帶領民進黨打贏選戰，邁向民進黨“完全執”政終極目標。以利未來府、院、黨的整合。
另一方面陳水扁也在遊錫�牷B蘇貞昌、謝長廷之間架構起平衡生態。據指出，高雄市長謝長廷受限于任期，雖未在這一波進入中央任職，陳水扁卻安排其嫡係人馬卓榮泰出任“總統府”副秘書長，且這項人事案是由陳水扁告知謝，再由謝通知卓，用意不言可諭。謝在任期屆滿後進入中央服務，亦指日可待。
人事變動一覽
“總統府”及“內閣”新人：“行政院秘書長” 葉國興、“國安會”秘書長邱義仁
“總統府”資政：原“國安會”秘書長康寧祥
“總統府”秘書長：蘇貞昌
“總統府”副秘書長：卓榮泰
“國安會”副秘書長：張旭成
“行政院長”：遊錫��
“行政院”副院長：葉菊蘭
“國防部長”：原“參謀總長”李傑
“參謀總長”：李天羽
“教育部長”：杜正勝
“內政部長”：蘇嘉全
“財政部長”：林全
“經濟部長”：何美
“交通部長”：林陵三
“環保署長”：張祖恩
“外交部長”：陳唐山
“駐美代表”：李大維
“陸委會”主委；吳釗燮
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