國務院臺灣事務辦公室發言人2008年10月21日就張銘清在臺遭暴力攻擊發表談話指出，我們對這種野蠻的暴力行為表示強烈憤慨和嚴厲譴責，並要求嚴懲肇事者，維護兩岸人民正常交往的權利。
國臺辦發言人指出，海峽兩岸關係協會副會長張銘清以廈門大學新聞傳播學院院長身份赴臺灣進行學術交流，今天上午在參觀臺南市孔廟時，竟然遭到一些極端分子暴力攻擊，人身安全與尊嚴受到嚴重傷害。我們對這種野蠻的暴力行為表示強烈憤慨和嚴厲譴責，並要求嚴懲肇事者，維護兩岸人民正常交往的權利。
發言人説，改善和發展兩岸關係符合兩岸同胞的共同願望。極少數人的破壞行徑，阻擋不了兩岸關係和平發展的趨勢，阻擋不了兩岸同胞加強交流合作的步伐。
