海峽兩岸關係協會2008年10月21日就張銘清在臺南市遭暴力襲擊事件致函臺灣海峽交流基金會，對這一野蠻暴力行為表示強烈憤慨和嚴厲譴責。
函電説：我會副會長張銘清先生以廈門大學新聞與傳播學院院長身份，應臺南藝術大學邀請，參加2008第七屆兩岸傳播暨影像藝術學術研討會，竟於今天上午遭極端分子暴力襲擊，人身安全與尊嚴受到嚴重傷害。我會對此十分震驚，對這一野蠻暴力行為表示強烈憤慨和嚴厲譴責，對極少數人罔顧臺灣大多數同胞意願、肆意破壞兩岸正常交流的行徑表示強烈不滿。請貴會轉告臺灣有關方面，嚴懲肇事者，並採取措施保護張銘清先生的人身安全，確保此類事端不再發生。
