長期以來,臺灣軍費開支一直保持較高水準,在臺財政總預算的各項支出的比例中始終名列首位。在50年代,軍費開支佔財政總預算的70%以上,60年代佔50%,1980年度佔47.2%,全額為28.69億美元;1986年度佔40%,臺灣當局公佈的金額為40億美元,實際開支為50億美元;1992年度"國防預算"在"總預算"中的比例下降為25.2%,但實際金額卻增加到92億美元。
臺灣的"國防預算",一般根據其用途分為公開和秘密兩大部分。近些年來,臺灣大量向外採購先進武器裝備,其軍費開支大幅增加,特別是海灣戰爭對臺灣軍方産生了強烈的刺激。李登輝和當時的"國防部長"陳履安先後指出,海灣戰爭有許多地方值得臺灣借鑒,軍方刊物《光華》雜誌在一篇文章中強調,"這次中東戰爭,美國使用了許多電子干擾技術,使得伊拉克軍方的電子通訊、情報系統完全停擺,指揮官完全無法下達正確的作戰指示,在未來,我們就應加強反電子系統的研究。"海灣戰爭結束後,臺灣軍方加緊發展"國防"科技,更新武器裝備,以提升戰力,阻止大陸武力進攻。按照制空、制海、反登陸的優先順序、借鑒海灣戰爭的教訓,更加重視制空、制海武器的採購、研製與電子戰技術的研究開發。比較1991年及1992年度臺灣國防預算可以發現,陸海空優先比重有些變化。在1992年度國防預算的武器裝備採購整備及製造上,制空裝備佔51%,制海裝備佔37%,反登陸裝備佔13%。這年臺灣向美、法兩國訂購150架F-16和60架幻影2000戰鬥機後,除每年正常的軍費預算之外,又通過特別預算的方式,編列了為期9年(1993年-2001年)、總額為115億美元的採購戰機特別預算。
90年代中期以來,臺灣軍費開支相對穩定,但仍有小幅增長,基本保持在100-110億美元左右,分別佔臺灣國民生産總值的5%和財政總預算的22%。1998年度,臺灣正式公佈的軍費預算為2780億元新台幣(當時約合100億美元),加上當年採購戰機特別預算撥款17億美元,該年度實際軍費預算達117億美元;若按臺灣地區總人口2180萬人計算,平均每人530美元,臺軍每人平均軍費為2.6萬美元,大大高於世界平均擁有的軍費數額。
近幾年來,臺灣的"國防預算"佔"總預算"的比例略有下降,一般為16.5%左右,2003年為16.63%,約75億美元(2615.6億元新台幣,1美元可兌34.7元新台幣),其中公開部分為2196.9億元新台幣,極機密部分為418.6億元新台幣,分別佔"國防預算"的83.9%和16.01%。
隨著時代的發展和臺灣軍事戰略的調整,臺軍費開支的重點又有變化。2003年度的"國防預算"中,軍事投資部分編列約570億元(新台幣下同),按項目區分為:資訊電子戰137億元(2002年更高達184億元)、防禦性反制武器研發44億元、缺裝補充51億元、制空67億元、制海81億元、地面防衛32億元、戰備工程48億元、教育訓練設施設備32億元、戰略支援76億元、基本生活設施2億元。