警總人員當年查封《美麗島》雜誌的場景
“兩蔣”統治時期曾製造了一系列冤假錯案，如今臺灣相關方面正在積極為當年的受害者平反。當年充當臺當局打手的是“警備總司令部”，簡稱警總。這個機構什麼都想管也什麼都能管，集黨、政、軍特權于一身，比如島內非法監聽就是它開的頭，讓人聞之色變。
1958年成立的“警備總司令部”是當時國民黨打擊異己的工具，第一任司令為黃鎮球。“警總”的任務包山包海，從監聽、郵檢、清除流氓到出入境管制，還兼管抓“匪諜”與政治犯。警總抓人的著名案例，包括1960年以“知匪不報”之名逮捕《自由中國》創辦人雷震；1961年的雲林縣議員蘇東啟案；1979年的吳泰安、余登發“匪諜案”；以及1979年的“美麗島案”等。
為了補償當年的受害者，臺當局如今成了“戒嚴時期不當匪諜暨叛亂案件補償基金會”，其董事張茂雄在1962年時，就曾和民進黨前主席施明德一起被扣上“意圖顛覆政府”的帽子。當時二人被“警總”刑訊逼供。張茂雄回憶説其手法最讓人生不如死的，就是不讓睡覺的疲勞審問。當時他在金門已經被連審一個禮拜，押回臺灣後再來一次，“一組兩個人、每兩小時換一組來問話，他們把我從小到大寫了十幾年的日記拿來反覆逼供，從那以後我再也不寫日記了”。
“警總”從成立到裁撤，到底辦過多少人，沒有人知道。張茂雄説，他只記得，10尺見方的空間，共有36個人被關在一起，“每個人只有20釐米寬的空間可以睡覺，所以大家只能側著睡，一個人翻身，其他人就要如同骨牌般跟著翻身”。
“警總”還有一項非常重要的任務是進行思想與文字檢查。黨外雜誌《八十年代》總編輯江春男曾經回憶，“‘警總’每次來查禁時，公文都已經蓋好章，但內容空著，隨便他們填，或者提前寫好一些含糊籠統的查禁理由，例如‘影響民心士氣’、‘違背發行旨趣’等”。江春男説：“我當時覺得很奇怪，雜誌都還沒印出來，他們怎麼就知道我們‘影響民心士氣’、‘違背發行旨趣’？”
在這一系列案件之後，民眾心中對“警總”産生了深深的恐懼，生怕什麼時候做了一人年連自己都不知道的錯事，被“警總”請去喝茶。這個能不能做，那個能不能想，在講話之前都要在心裏先自我審查一番，久而久之就有了一句名言“每個人心中都有一個小‘警總’”。
“美麗島事件”後，受刑人家屬和辯護律師嚴詞抨擊“警總”，並要求其接受“國會”監督。1987年“解嚴”前夕，“警總”更備受社會質疑。1992年，“警總”于“國防部長”陳履安任內正式裁撤，如今改制為“行政院海岸巡防署”。
