儘管兩岸清明有著很多相似的習俗，但臺灣島內清明也有些不一樣的地方。
漳州籍閩南人不過清明
臺灣並非每個族群都過清明節，比如祖籍漳州的閩南人，就不過清明節。相傳，當年鄭成功起兵“反清復明”，厭惡清明節的“清”在“明”前面，於是下令廢除清明節，改三月初三“上巳日”為掃墓日。
另外，客家人從元宵節過後便開始祭祖，日期由每家自定，一直到清明為止。
掃墓之外的習俗
臺灣過去有“清明不回厝無祖”的説法，這足見島內民眾對這個節日的重視程度。臺灣幾乎每次清明節都可放假3—4天。
臺灣過清明的習俗和閩南雖然差不多，但也有一些不同，除了傳統的“挂紙”和掃墓外，臺灣在清明節期間還有踏青、鬥雞、插柳、拔河、盪鞦千、賜火等活動。
清明節差點被廢除
有兩三千年曆史的清明節，前些年在臺灣竟差點被廢除。2007年4月，當時島內掀起新一波“去中國化”浪潮，民進黨中常會通過決議，建議廢除清明節的法定假期，改立《自由時代》創辦人鄭南榕自焚的4月7日為臺灣的“言論自由日”，並要求時任“行政院長”的蘇貞昌儘快辦理。消息既出，引發藍營以及廣大民眾的強烈反彈，民進黨的陰謀最終沒能得逞。
亦是蔣介石的忌日
清明節這天，也是蔣介石的忌日。
時光進入1975年，患上肺炎和心臟病的蔣介石，病情一日重似一日。到了4月5日，蔣經國早上來看望時，蔣介石的情況似乎有了好轉，並露出久違的笑容。但晚上病情開始惡化，心臟出現衰竭。雖經搶救，還是于23時50分停止呼吸，終沒能度過清明的夜晚。因此在臺灣，清明也是“蔣公紀念日”，臺當局後來將其列為法定節日，放假一天。每當清明前後，國民黨高層前往大溪慈湖謁蔣陵，成為雷打不動的任務。
