“中國第一大島是海南島”、“我國最高山是玉山”、“李白是中國的偉大詩人，而不是我國的詩人”、“我國國土面積是3.6萬多平方公里”。清朝統治寫成清領(清朝佔領)，清朝、鄭成功、國民黨執政都被視為外來政權。與此同時，南京大屠殺從歷史課本上抹去，日本侵略臺灣的表述從“日據”變成了“日治”，“抗戰勝利”變成了“終戰”。教科書中甚至出現了美化日本暴行與犯罪的內容，慰安婦的來源被寫成“除了風塵女子，還有自願參加海外慰安工作的婦女”。
上世紀90年代李登輝執政以後，教科書在“臺獨”意識形態下被逐漸“去中國化”。高中生學習的歷史，不再從週口店山頂洞人的中國古代史開始，而是由圓山遺址的臺灣史開始，“臺灣史”完全從中國史中割裂出來。教科書的長寬不過10幾20釐米，但方寸間卻能主導一個民族的精神走向和價值判斷。近年來，修改歷史教科書的呼聲越來越高，臺灣佛光大學文學系主任謝大寧教授直言，民進黨的“臺獨”歷史觀，造成臺灣民眾對大陸的認同撕裂，正是學習了這樣的歷史教科書，才造成現在30歲以下人的認知就是兩岸“一邊一國”。
馬英九面臨的真正挑戰
臺灣的教科書在上世紀90年代以前都是統一編寫的“統編本”，上世紀90年代，臺灣實行教育改革，課本由“統編本”改為在課綱(教科書大綱)指導下的“審定本”，即民間出版社可編輯課本送審後印刷，各中小學自行採用。馬英九在第一任期籌組“高中歷史教科書課綱修訂小組委員會”，對陳水扁時期“臺獨”色彩明顯的課綱進行了修訂，並於2011年5月公告，擬於2012年8月1日起實施。“課綱修訂的重點，就是去除‘皇民化’和‘臺獨’內容，按規定，書商必須依修改後的課綱編寫課本。”當時參與修訂課綱的臺灣世新大學教授王曉波教授介紹説。
5月加入“高中歷史教科書審定委員會”的臺灣大學政治係教授張亞中表示，新編寫出來的高中歷史課本，竟然還有許多與新課綱相悖的，因此此次審定的重點是刪除書中可能會造成“兩國論”影響的用語。
