另兩份正式解密的公文顯示，“經建會前主委”何美玥兩度以“政務委員”身份上極機密專簽，未通過“經建會”及“國發基金”；第一份極機密公文呈“行政院長”蘇貞昌及蔡英文，第二份只呈給蔡英文。國民黨“立委”林益世等痛批，“蔡英文竟自己決掉（公文）了！蘇貞昌被蔡英文蒙了。”
劉憶如出示解密文件，一份是2007年2月9日由尚未出任“國發基金”召集人的何美玥以“政務委員”身份上簽，主旨是請蘇貞昌、蔡英文同意，由“中研院長”翁啟惠代表“政院”與美國Genentech生技洽談，內容主要是授權翁啟惠，在對方同意“未來大量生産之工廠在臺灣”條件下，臺方才會同意在6億元新台幣範圍內投資。
第二份是同年3月21日何美玥出任“國發基金”召集人後，仍以“政務委員”身份簽呈給蔡英文，內容主要是合作案的後續辦理情形，TaiMed（臺懋蛋白科技、宇昌生技公司的前身）首度出現在官方文書上。“立委”吳清池、林滄敏表示，兩分極機密公文都顯示並無重大機密，卻揭露了蔡英文在宇昌案的關鍵角色、説詞矛盾。
劉憶如：為何告我？ 我要辭職
“經建會主委”劉憶如昨天深夜表示，“國發基金”投資宇昌案引發的爭議，最近所有人都不斷問她當初投資過程的細節，民進黨更表示要告她，“我覺得此事到此已too much（過頭了）”，“我不想奉陪了，我要辭職！”
劉憶如説，民進黨執政期間，“國發基金”投資宇昌案的過程，所有的紀錄、資料都是他們留下來的，現在卻變成所有的人都在問她“這個為什麼會這樣、那個為什麼會這樣”，“我又不是當事人，我怎麼知道那些過程是為什麼？應該去問蔡英文或何美玥。”
