據臺灣“中廣新聞網”報道，馬英九宣示要擴充南沙太平島的碼頭和機場跑道等設施，但是媒體報道，擴建機場的預算要由哪個單位來負責，卻發生“海巡署”和防務部門各有主張，沒人認帳的奇特狀況。
東沙和太平兩個島嶼目前是由臺“海巡署”駐守，外界雖有讓陸戰隊重返太平島的建議，但馬英九日前在接受媒體專訪時表示，“海巡署”本來就是海上執法單位，因此由海巡駐守“沒什麼不好”，而且太平島的碼頭和機場等設施，現在也正在擴充“第一步是把相當崩壞的碼頭修好，補給船艦才能夠順利靠岸，第二是把目前的機場作整修，現在已經在進行當中，這一點是一定要做的！”
不過，根據媒體報道，到底該由誰編列機場擴建的預算，卻發生“海巡署”和防務部門“互踢皮球”的情況。由于太平島目前是由海巡駐守，機場卻是由空軍使用，到底該由誰買單，雙方各有意見。太平島機場是由島上原有的“中央公路”加寬加厚而成的簡易跑道，長度1150公尺，可以讓C-130運輸機在半裝載的情況下起降，目前的計劃是透過填海加長350公尺，增加起降的安全性，也可以運補更多物資。
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