自2005年大陸不斷擴大臺灣水果進口準入範圍以來，臺灣水果及部分農産品(行情論壇)出口大陸取得一定成效，但專家表示，目前臺灣水果出口大陸仍面臨運輸成本高等五大突出問題。

　　18日，在“海峽兩岸品牌農業發展論壇”上，中國農業科學研究院海峽兩岸農業發展研究中心主任任愛榮表示，根據2007年的調研結果顯示，臺灣水果及部分農産品出口大陸目前仍存在的突出問題在於：

　　一是運輸成本高。由於兩岸目前仍未實現直航，臺灣水果出口大陸的運輸線路仍要繞經第三地轉口進入大陸，致使臺灣水果出口到一些主要大城市的運輸成本仍居高不下。

　　二是建立穩定市場銷售渠道與貨源供應的矛盾。兩年來該中心多次到福建、廣東、上海、北京超市和賣場做過調研，超市運營商始終反映臺灣水果量太少，不能形成穩定供貨，幾乎不可能設立專櫃來銷售。

　　三是通關便利與嚴格檢疫的矛盾。自2005 年3月起，大陸許多口岸的海關、檢疫部門相繼出臺便捷通關措施，以保證臺灣農産品（水果）快速、及時通關。廣州、福建和上海等地基本相似。福建檢疫部門的調研顯示，這些快速檢疫措施加快了臺灣水果的通關速度，但對於檢疫部門而言，快速檢疫和嚴格控制疫病蟲害的進入是個兩難選擇。

　　四是臺灣水果進口運營商對大陸內銷市場通路不熟悉，還未形成成熟的運銷網路。近兩年來臺灣水果進入大陸的總量規模有限，多數以展銷會的形式售賣，只有少數商家建立起了自己的分銷渠道和網路，但在規模上與大陸水果運營商相比差距懸殊，因而交易成本高，甚至水果出口到大陸後出現賣難問題。

　　五是臺灣地區水果面臨東南亞國家進口水果和大陸本地水果的競爭。