恩施市生物資源種類很多。農作物種類齊全、品種繁多。主要有玉米、水稻、黃豆、紅苕、油菜、小麥、洋芋、花生、魔芋、蕓豆等。
畝產萬斤的魔芋高產栽培
森林植被植物種類有50科、163屬、354種。其中喬木92種、灌木151種。木質藤本26種。 珍貴樹種有銀杏、金錢松、穗花杉、珙楓等。木本藥材有厚樸、杜仲、黃嗋、黃柏。大量的有油桐、烏柏、生漆、棕櫚、柑桔、茶葉、梨子、板栗、杉木、馬尾松、華山松、竹類、油茶等。野生植物有五倍子、獼猴桃、刺梨等。
畜牧資源豐富，經勞動人民長期飼養選育了豬、牛、馬、羊、雞、鴨等地方良種。 牧草有104 科、 321屬、476種。主要有芒草、白茅、鴨茅、野葛、亂子草、野青茅等。
恩施市潛藏著較為豐富的水產資源，它們主要包括近萬畝可開發的宜漁水面，近萬畝可綜合利用的稻田以及6000多畝低產、低凹、荒蕪沼澤地等水土淘汰；白甲魚、裂腹魚、平鰭鰍、鯰魚、黃顙、黃鱔等多種魚類資源和陸生旱草藤葉、水生扎草、萍沙及玉米、麥類、豆類、薯類加工付產品等豐富的殖類餌料資源；更有體現恩施山區特點的大鯢、棘胸蛙、中華鱉、搎菜、茭白、蓮藕等重要水生經濟動植物資源。這些資源的綜合開發利用已經和正在給恩施經濟的發展、社會的進步帶來勃勃生機。
藥材資源也十分豐富，以黃蓮、黨參、當歸、天麻、百合、車前子、通草等為大宗。野生藥材品種有213個。
野生動物有野豬、狐狸、山野羊、狼、獐子、麂子、草兔、山雞、錦雞等。
特產作物產品有：茶葉、苧麻、柑桔、黨參、當歸、紫油、厚樸等，引進擴繁品種有白肋煙、烤煙、黃連等，白肋煙、烤煙發展迅速。
森林資源
全市森林用地合計375.8萬畝,有林地面積298.53萬畝；林分面積257.3萬畝，其中用材林面積129.6萬畝、防護林面積117.9萬畝、薪炭林面積8.94 萬畝、特用林面積0.86萬畝,經濟林面積41.23萬畝。疏林地10.63萬畝。灌木林地39.2萬畝。未成林造林地23.16萬畝。苗圃地0.2萬畝。無林地4.08萬畝。 森林覆蓋率為56%。
