9月

　　1日，“國防部”軍事發言人虞思祖少將表示，馬英九指示，將減購15架黑鷹直升機，此經費用來採購救難直升機與相關裝備，“國防部”受令後即積極與“內政部”協商，在“成本低”、“獲得快”和“效益高”3點因素考慮下，盡速達成馬指示提升救災能力的要求。

　　2日，空軍官校80周年校慶。

　　2日，“行政院長”劉兆玄頒獎表揚臺軍執行“8·8水災”救災任務有功的單位及個人。

　　3日，鑒于“莫拉克”臺風重創南臺灣，造成部份地區嚴重災情及人員傷亡，“國防部”表示，已遵照馬英九指示，將“災害防救”列為臺軍的中心任務之一，未來臺軍在臺風季節期間，將5個作戰區做好分配與規劃，將可能造成災害的地區依作戰區劃分，主動將機具、人力投入需要救援的地方，讓救災的時間可以縮短，讓災民痛苦煎熬的時間可以減少。

　　7日，針對媒體刊載“直升機會計學”一事，“國防部”軍事發言人室特別指出，臺軍統一採購60架黑鷹直升機，其中15架移撥“內政部”使用，係考慮“成本低”、“獲得快”及“效益高”等因素，可以強化“政府”救災功能，發揮整體資源的最大效益。

　　10日，“行政院”暨所屬各主管機關卸、新任首長聯合交接典禮在“行政院”大禮堂舉行，其中包括新任“國防部長”高華柱與前任“國防部長”陳肇敏進行交接。

　　18日，臺軍方媒體披露，近年來馬祖地區開放觀光，“馬防部”為避免旅客及馬祖民眾誤闖軍事禁地，造成危安及軍民糾紛事件，指示所屬單位查明土地歸屬，並檢整、制作“軍事管制區”告示牌。

　　21日，海軍司令高廣圻上將在海軍司令部政戰主任孫宜成中將等人陪同下，視導海軍艦隊指揮部所屬一九二艦隊、一五一艦隊、一二四艦隊及陸戰隊指揮部戰備現況。

　　23日，為使臺灣民眾了解臺軍軍事新聞傳布運用“衛星傳送”的新領域，“國防部”軍事新聞通訊社在“國防部”記者會中，首度對外公開建置完成的“新聞衛星傳送係統”，並說明將在今年“紀念古寧頭六十周年”係列活動中，將實時傳輸活動畫面，已達信息共享目的，也代表臺軍在未來提供的軍聞服務，將不受時空限制，可實時提供最權威、準確的“國防政策”信息。

　　24日，由“國防部”軍備局生產制造中心第二○四廠研發的“新型炊爨車”，在“國防部”舉辦的媒體參訪中，首度公開亮相。

　　25日，“2009年臺北國際發明暨技術交易展”在臺北世貿中心一館舉行。“國防部”規劃有“智慧生活”、“綠色能源”、“醫療保健”等3大主題，由軍備局中科院、軍備局生產制造中心、“國防醫學院”及“國防大學理工學院”等4個單位，展出54項展品及134四項專利技術。

　　28日，“國防部”軍事發言人室表示，“總統府”前“侍衛長”陳添勝中將于2009年9月25日卸任同時，已調任“國防部”“部長辦公室”中將參事。另“陸軍司令部”中將“參謀長”由陸軍步兵訓練指揮部暨步校中將指揮官兼校長朱玉書中將調任；“海軍陸戰隊指揮部”中將指揮官由海軍陸戰隊指揮部副指揮官夏復華少將調任。上述兩項重要軍職人事調整均于2009年10月1日生效。

　　29日，針對媒體報導“馬上臺一年情治監聽有增無減”一事，“國防部”表示，“軍情局”執行兩岸跨境情報通訊監察作業，是依“通信保障及監察法”及“國家情報工作法”所建立的相關機制進行。

　　30日，“國防部”軍事發言人室表示，臺軍2009年10月1日核定將級重要軍職人事調整如下：陸軍馬防部中將指揮官職缺，由陸軍第十軍團指揮部副指揮官羅際琴少將調任；陸軍第十軍團指揮部中將副指揮官職缺，由陸軍炮訓部暨飛彈炮兵學校指揮官兼校長鍾邦新中將調任。陸軍炮訓部暨飛彈炮兵學校中將指揮官兼校長職缺，由陸軍司令部人事軍務處處長湯家坤少將調任；陸軍步訓部暨步兵學校中將指揮官兼校長職缺，由陸軍專科學校校長潘家宇少將調任。

　　30日，“國防部長”高華柱率領各業務主管，前往“立法院外交及國防委員會”進行業務報告，報告區分“臺軍‘8·8水災’救災經過概述與策進作為”、“兩岸互動與軍事形勢”及“戰力整建”等3個面向，闡述臺軍未來“國防施政”方針。